MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 chromosome

Total Repeats: 48466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010321	ATC	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036432
2	NC_010321	CCA	2	6	143	148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036432
3	NC_010321	ACA	2	6	152	157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036432
4	NC_010321	ATT	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036432
5	NC_010321	GAT	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036432
6	NC_010321	A	6	6	231	236	100 %	0 %	0 %	0 %	167036432
7	NC_010321	TAA	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036432
8	NC_010321	AT	3	6	252	257	50 %	50 %	0 %	0 %	167036432
9	NC_010321	ACG	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036432
10	NC_010321	AAAT	2	8	291	298	75 %	25 %	0 %	0 %	167036432
11	NC_010321	AGA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
12	NC_010321	GAA	3	9	328	336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
13	NC_010321	ACT	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036432
14	NC_010321	TTTA	2	8	507	514	25 %	75 %	0 %	0 %	167036432
15	NC_010321	GGA	2	6	520	525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036432
16	NC_010321	ATGC	2	8	550	557	25 %	25 %	25 %	25 %	167036432
17	NC_010321	TACGT	2	10	604	613	20 %	40 %	20 %	20 %	167036432
18	NC_010321	AGTT	2	8	632	639	25 %	50 %	25 %	0 %	167036432
19	NC_010321	GAC	2	6	652	657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036432
20	NC_010321	GAA	2	6	664	669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
21	NC_010321	TTC	2	6	698	703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036432
22	NC_010321	GAT	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036432
23	NC_010321	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	167036432
24	NC_010321	GAAC	2	8	736	743	50 %	0 %	25 %	25 %	167036432
25	NC_010321	AAG	2	6	746	751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
26	NC_010321	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036432
27	NC_010321	ACC	2	6	816	821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036432
28	NC_010321	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
29	NC_010321	CCA	2	6	892	897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036432
30	NC_010321	CGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036432
31	NC_010321	A	6	6	986	991	100 %	0 %	0 %	0 %	167036432
32	NC_010321	TCAA	2	8	993	1000	50 %	25 %	0 %	25 %	167036432
33	NC_010321	AG	3	6	1006	1011	50 %	0 %	50 %	0 %	167036432
34	NC_010321	TAA	2	6	1025	1030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036432
35	NC_010321	TAA	2	6	1110	1115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036432
36	NC_010321	GA	3	6	1119	1124	50 %	0 %	50 %	0 %	167036432
37	NC_010321	GAA	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
38	NC_010321	AGA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
39	NC_010321	A	6	6	1206	1211	100 %	0 %	0 %	0 %	167036432
40	NC_010321	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036432
41	NC_010321	TAC	2	6	1305	1310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036432
42	NC_010321	A	6	6	1328	1333	100 %	0 %	0 %	0 %	167036432
43	NC_010321	TC	3	6	1362	1367	0 %	50 %	0 %	50 %	167036432
44	NC_010321	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	167036433
45	NC_010321	TG	4	8	1654	1661	0 %	50 %	50 %	0 %	167036433
46	NC_010321	ATT	2	6	1672	1677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036433
47	NC_010321	G	6	6	1701	1706	0 %	0 %	100 %	0 %	167036433
48	NC_010321	ACT	2	6	1718	1723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036433
49	NC_010321	TTC	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036433
50	NC_010321	GTCAA	2	10	1764	1773	40 %	20 %	20 %	20 %	167036433
51	NC_010321	AGA	3	9	1828	1836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036433
52	NC_010321	TAG	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036433
53	NC_010321	TAA	2	6	2055	2060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036433
54	NC_010321	TA	3	6	2176	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	167036433
55	NC_010321	AGA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036433
56	NC_010321	AGAGAT	2	12	2293	2304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167036433
57	NC_010321	GAAG	2	8	2369	2376	50 %	0 %	50 %	0 %	167036433
58	NC_010321	AAT	2	6	2489	2494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036433
59	NC_010321	TTA	2	6	2523	2528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036433
60	NC_010321	TCT	2	6	2534	2539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036433
61	NC_010321	GAT	2	6	2557	2562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036433
62	NC_010321	A	6	6	2565	2570	100 %	0 %	0 %	0 %	167036433
63	NC_010321	TTA	2	6	2624	2629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036433
64	NC_010321	GAA	3	9	2651	2659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036433
65	NC_010321	TAA	3	9	2694	2702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036433
66	NC_010321	AT	3	6	2805	2810	50 %	50 %	0 %	0 %	167036434
67	NC_010321	GGA	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036434
68	NC_010321	AAGCA	2	10	2861	2870	60 %	0 %	20 %	20 %	167036434
69	NC_010321	ATTT	2	8	2871	2878	25 %	75 %	0 %	0 %	167036434
70	NC_010321	A	6	6	2926	2931	100 %	0 %	0 %	0 %	167036434
71	NC_010321	A	6	6	3045	3050	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
72	NC_010321	AATA	2	8	3067	3074	75 %	25 %	0 %	0 %	167036435
73	NC_010321	TTA	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
74	NC_010321	TAA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036435
75	NC_010321	ATT	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
76	NC_010321	AAT	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036435
77	NC_010321	A	7	7	3236	3242	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
78	NC_010321	AATAA	2	10	3293	3302	80 %	20 %	0 %	0 %	167036435
79	NC_010321	T	6	6	3342	3347	0 %	100 %	0 %	0 %	167036435
80	NC_010321	ATA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036435
81	NC_010321	AAG	2	6	3372	3377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036435
82	NC_010321	TGT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036435
83	NC_010321	AAAAGT	2	12	3509	3520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036435
84	NC_010321	TGA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036435
85	NC_010321	TAG	2	6	3546	3551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036435
86	NC_010321	TGA	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036435
87	NC_010321	ATT	2	6	3585	3590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
88	NC_010321	A	6	6	3592	3597	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
89	NC_010321	A	7	7	3613	3619	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
90	NC_010321	CAG	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036435
91	NC_010321	GAA	2	6	3695	3700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036435
92	NC_010321	A	7	7	3707	3713	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
93	NC_010321	ACA	2	6	3764	3769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036435
94	NC_010321	ATT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036435
95	NC_010321	TTC	2	6	3832	3837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036435
96	NC_010321	A	6	6	3895	3900	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
97	NC_010321	A	7	7	3964	3970	100 %	0 %	0 %	0 %	167036435
98	NC_010321	TAC	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036435
99	NC_010321	GTT	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036435
100	NC_010321	A	6	6	4091	4096	100 %	0 %	0 %	0 %	167036436
101	NC_010321	GGC	2	6	4111	4116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036436
102	NC_010321	ACT	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036436
103	NC_010321	GAA	3	9	4210	4218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036436
104	NC_010321	TAT	2	6	4287	4292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036436
105	NC_010321	TTAT	3	12	4289	4300	25 %	75 %	0 %	0 %	167036436
106	NC_010321	AAG	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036436
107	NC_010321	A	6	6	4337	4342	100 %	0 %	0 %	0 %	167036436
108	NC_010321	A	6	6	4373	4378	100 %	0 %	0 %	0 %	167036437
109	NC_010321	TTG	2	6	4391	4396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036437
110	NC_010321	AAG	2	6	4411	4416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
111	NC_010321	ATT	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
112	NC_010321	A	6	6	4475	4480	100 %	0 %	0 %	0 %	167036437
113	NC_010321	GAAAG	2	10	4501	4510	60 %	0 %	40 %	0 %	167036437
114	NC_010321	AAGAA	2	10	4536	4545	80 %	0 %	20 %	0 %	167036437
115	NC_010321	ATAA	2	8	4588	4595	75 %	25 %	0 %	0 %	167036437
116	NC_010321	TAAT	2	8	4637	4644	50 %	50 %	0 %	0 %	167036437
117	NC_010321	GGA	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036437
118	NC_010321	AGA	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
119	NC_010321	A	6	6	4753	4758	100 %	0 %	0 %	0 %	167036437
120	NC_010321	T	6	6	4839	4844	0 %	100 %	0 %	0 %	167036437
121	NC_010321	T	7	7	4902	4908	0 %	100 %	0 %	0 %	167036437
122	NC_010321	TAT	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
123	NC_010321	ATT	2	6	4967	4972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
124	NC_010321	TTTA	2	8	4975	4982	25 %	75 %	0 %	0 %	167036437
125	NC_010321	CAG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036437
126	NC_010321	AG	4	8	5097	5104	50 %	0 %	50 %	0 %	167036437
127	NC_010321	AT	3	6	5155	5160	50 %	50 %	0 %	0 %	167036437
128	NC_010321	AGC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036437
129	NC_010321	AGT	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036437
130	NC_010321	GAG	2	6	5332	5337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036437
131	NC_010321	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036437
132	NC_010321	AAG	3	9	5420	5428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
133	NC_010321	TGG	2	6	5437	5442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036437
134	NC_010321	ATGA	2	8	5497	5504	50 %	25 %	25 %	0 %	167036437
135	NC_010321	CTA	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036437
136	NC_010321	ATA	2	6	5546	5551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036437
137	NC_010321	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036437
138	NC_010321	TATGGC	2	12	5613	5624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167036437
139	NC_010321	GCT	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036437
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141	NC_010321	CTT	2	6	5752	5757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036437
142	NC_010321	ATG	3	9	5758	5766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036437
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267	NC_010321	A	6	6	11066	11071	100 %	0 %	0 %	0 %	167036442
268	NC_010321	TA	3	6	11075	11080	50 %	50 %	0 %	0 %	167036442
269	NC_010321	TTG	2	6	11100	11105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036442
270	NC_010321	GA	3	6	11125	11130	50 %	0 %	50 %	0 %	167036442
271	NC_010321	CTATG	2	10	11161	11170	20 %	40 %	20 %	20 %	167036442
272	NC_010321	GTT	2	6	11219	11224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036442
273	NC_010321	GA	3	6	11308	11313	50 %	0 %	50 %	0 %	167036442
274	NC_010321	ATAA	2	8	11426	11433	75 %	25 %	0 %	0 %	167036442
275	NC_010321	CTTC	2	8	11489	11496	0 %	50 %	0 %	50 %	167036442
276	NC_010321	TCC	2	6	11560	11565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167036442
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301	NC_010321	AT	3	6	12645	12650	50 %	50 %	0 %	0 %	167036442
302	NC_010321	TGT	2	6	12675	12680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036442
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304	NC_010321	TA	3	6	12702	12707	50 %	50 %	0 %	0 %	167036442
305	NC_010321	GA	3	6	12789	12794	50 %	0 %	50 %	0 %	167036442
306	NC_010321	AGA	2	6	12826	12831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036442
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360	NC_010321	A	7	7	15816	15822	100 %	0 %	0 %	0 %	167036445
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386	NC_010321	GAA	2	6	17274	17279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036446
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389	NC_010321	TAA	2	6	17399	17404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036446
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392	NC_010321	AAT	2	6	17510	17515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036446
393	NC_010321	GAA	2	6	17548	17553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036446
394	NC_010321	TTGAA	2	10	17560	17569	40 %	40 %	20 %	0 %	167036446
395	NC_010321	AAT	2	6	17589	17594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036446
396	NC_010321	CAGA	2	8	17644	17651	50 %	0 %	25 %	25 %	167036446
397	NC_010321	A	6	6	17651	17656	100 %	0 %	0 %	0 %	167036446
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